Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 INH1YDL181W 258 nt7.42□□□□□ -1.22
SEH1P53011 YLR460CYLR460C 1131 nt7.41□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 YMR166CYMR166C 1107 nt7.4□□□□□ -1.22
SEH1P53011 HBS1YKR084C 1836 nt7.4□□□□□ -1.23
SEH1P53011 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.39□□□□□ -1.23
SEH1P53011 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.39□□□□□ -1.23
SEH1P53011 YOR343CYOR343C 327 nt7.39□□□□□ -1.23
SEH1P53011 LSP1YPL004C 1026 nt7.39□□□□□ -1.23
SEH1P53011 HRA1HRA1 564 nt7.38□□□□□ -1.23
SEH1P53011 YBL095WYBL095W 813 nt7.38□□□□□ -1.23
SEH1P53011 PAU21YOR394W 495 nt7.38□□□□□ -1.23
SEH1P53011 PAU22YPL282C 495 nt7.38□□□□□ -1.23
SEH1P53011 GRH1YDR517W 1119 nt7.37□□□□□ -1.23
SEH1P53011 YJL160CYJL160C 864 nt7.37□□□□□ -1.23
SEH1P53011 YIL177CYIL177C 5277 nt7.37□□□□□ -1.23
SEH1P53011 AGP3YFL055W 1677 nt7.37□□□□□ -1.23
SEH1P53011 RPL12BYDR418W 498 nt7.36□□□□□ -1.23
SEH1P53011 CHS7YHR142W 951 nt7.36□□□□□ -1.23
SEH1P53011 EMC3YKL207W 762 nt7.36□□□□□ -1.23
SEH1P53011 AAC3YBR085W 924 nt7.36□□□□□ -1.23
SEH1P53011 YMC2YBR104W 990 nt7.36□□□□□ -1.23
SEH1P53011 BEM1YBR200W 1656 nt7.35□□□□□ -1.23
SEH1P53011 GNP1YDR508C 1992 nt7.35□□□□□ -1.23
SEH1P53011 MET22YOL064C 1074 nt7.35□□□□□ -1.23
SEH1P53011 PUS7YOR243C 2031 nt7.34□□□□□ -1.23
SEH1P53011 CAK1YFL029C 1107 nt7.34□□□□□ -1.23
SEH1P53011 RRT14YIL127C 621 nt7.34□□□□□ -1.23
SEH1P53011 YIR035CYIR035C 765 nt7.34□□□□□ -1.23
SEH1P53011 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.34□□□□□ -1.23
SEH1P53011 NPP2YEL016C 1482 nt7.34□□□□□ -1.23
SEH1P53011 TMS1YDR105C 1422 nt7.34□□□□□ -1.23
SEH1P53011 OCH1YGL038C 1443 nt7.34□□□□□ -1.23
SEH1P53011 GGC1YDL198C 903 nt7.33□□□□□ -1.24
SEH1P53011 MRS4YKR052C 915 nt7.33□□□□□ -1.24
SEH1P53011 OLA1YBR025C 1185 nt7.33□□□□□ -1.24
SEH1P53011 Q0010Q0010 387 nt7.33□□□□□ -1.24
SEH1P53011 YMR210WYMR210W 1350 nt7.33□□□□□ -1.24
SEH1P53011 CTF3YLR381W 2202 nt7.32□□□□□ -1.24
SEH1P53011 PDC6YGR087C 1692 nt7.32□□□□□ -1.24
SEH1P53011 MRP1YDR347W 966 nt7.31□□□□□ -1.24
SEH1P53011 RNA170RNA170 169 nt7.31□□□□□ -1.24
SEH1P53011 PET18YCR020C 648 nt7.3□□□□□ -1.24
SEH1P53011 YIL108WYIL108W 2091 nt7.29□□□□□ -1.24
SEH1P53011 YJR149WYJR149W 1215 nt7.29□□□□□ -1.24
SEH1P53011 AIM34YMR003W 597 nt7.29□□□□□ -1.24
SEH1P53011 TOP3YLR234W 1971 nt7.28□□□□□ -1.24
SEH1P53011 BUB2YMR055C 921 nt7.28□□□□□ -1.24
SEH1P53011 YER156CYER156C 1017 nt7.27□□□□□ -1.25
SEH1P53011 MFT1YML062C 1179 nt7.27□□□□□ -1.25
SEH1P53011 AAT1YKL106W 1356 nt7.27□□□□□ -1.25
SEH1P53011 FET5YFL041W 1869 nt7.26□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YJL009WYJL009W 327 nt7.26□□□□□ -1.25
SEH1P53011 GDH1YOR375C 1365 nt7.25□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YBR056WYBR056W 1506 nt7.25□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YEL023CYEL023C 2049 nt7.25□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YPT31YER031C 672 nt7.23□□□□□ -1.25
SEH1P53011 BXI1YNL305C 894 nt7.23□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YPR084WYPR084W 1371 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 snR86snR86 1004 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 UTR5YEL035C 501 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 YOR268CYOR268C 399 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 RPS6AYPL090C 711 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 RHO1YPR165W 630 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 RPS6BYBR181C 711 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 ITR1YDR497C 1755 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 ADA2YDR448W 1305 nt7.22□□□□□ -1.25
SEH1P53011 ADE16YLR028C 1776 nt7.21□□□□□ -1.25
SEH1P53011 GUT1YHL032C 2130 nt7.21□□□□□ -1.26
SEH1P53011 MEP1YGR121C 1479 nt7.2□□□□□ -1.26
SEH1P53011 TAD2YJL035C 753 nt7.2□□□□□ -1.26
SEH1P53011 YMR206WYMR206W 942 nt7.19□□□□□ -1.26
SEH1P53011 PFS2YNL317W 1398 nt7.19□□□□□ -1.26
SEH1P53011 ATP2YJR121W 1536 nt7.18□□□□□ -1.26
SEH1P53011 THI73YLR004C 1572 nt7.18□□□□□ -1.26
SEH1P53011 PUP3YER094C 618 nt7.18□□□□□ -1.26
SEH1P53011 MSB3YNL293W 1902 nt7.18□□□□□ -1.26
SEH1P53011 EDC2YER035W 438 nt7.17□□□□□ -1.26
SEH1P53011 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.17□□□□□ -1.26
SEH1P53011 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.17□□□□□ -1.26
SEH1P53011 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.17□□□□□ -1.26
SEH1P53011 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.17□□□□□ -1.26
SEH1P53011 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.17□□□□□ -1.26
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