Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1cP52432 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1cP52432 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1cP52432 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1cP52432 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms