Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcd1P48410 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcd1P48410 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Abcd1P48410 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcd1P48410 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcd1P48410 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcd1P48410 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms