Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sipa1P46062 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sipa1P46062 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sipa1P46062 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sipa1P46062 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sipa1P46062 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sipa1P46062 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms