Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms