Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa11P31311 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa11P31311 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa11P31311 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa11P31311 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa11P31311 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxa11P31311 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa11P31311 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa11P31311 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa11P31311 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa11P31311 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa11P31311 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa11P31311 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa11P31311 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa11P31311 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms