Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata1P17679 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gata1P17679 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata1P17679 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata1P17679 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gata1P17679 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gata1P17679 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata1P17679 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata1P17679 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata1P17679 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata1P17679 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata1P17679 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gata1P17679 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata1P17679 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata1P17679 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata1P17679 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata1P17679 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata1P17679 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata1P17679 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gata1P17679 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata1P17679 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata1P17679 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.5 ms