Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrm1P12657 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrm1P12657 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrm1P12657 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrm1P12657 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms