Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp28P10078 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp28P10078 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp28P10078 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp28P10078 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp28P10078 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp28P10078 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp28P10078 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp28P10078 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp28P10078 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp28P10078 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp28P10078 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp28P10078 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp28P10078 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp28P10078 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp28P10078 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp28P10078 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp28P10078 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp28P10078 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zfp28P10078 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp28P10078 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp28P10078 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zfp28P10078 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp28P10078 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms