Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HbaP01942 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HbaP01942 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HbaP01942 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HbaP01942 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HbaP01942 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HbaP01942 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HbaP01942 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HbaP01942 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HbaP01942 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HbaP01942 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HbaP01942 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HbaP01942 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HbaP01942 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HbaP01942 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HbaP01942 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HbaP01942 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HbaP01942 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HbaP01942 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HbaP01942 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HbaP01942 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HbaP01942 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HbaP01942 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HbaP01942 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HbaP01942 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HbaP01942 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HbaP01942 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HbaP01942 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HbaP01942 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HbaP01942 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HbaP01942 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HbaP01942 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HbaP01942 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HbaP01942 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HbaP01942 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HbaP01942 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HbaP01942 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HbaP01942 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HbaP01942 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HbaP01942 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HbaP01942 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HbaP01942 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HbaP01942 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HbaP01942 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HbaP01942 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HbaP01942 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HbaP01942 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HbaP01942 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HbaP01942 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HbaP01942 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HbaP01942 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HbaP01942 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HbaP01942 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HbaP01942 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HbaP01942 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HbaP01942 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HbaP01942 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HbaP01942 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HbaP01942 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HbaP01942 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HbaP01942 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HbaP01942 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HbaP01942 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HbaP01942 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HbaP01942 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HbaP01942 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HbaP01942 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HbaP01942 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HbaP01942 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HbaP01942 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HbaP01942 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HbaP01942 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HbaP01942 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HbaP01942 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HbaP01942 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HbaP01942 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HbaP01942 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HbaP01942 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HbaP01942 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HbaP01942 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HbaP01942 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HbaP01942 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HbaP01942 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HbaP01942 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HbaP01942 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HbaP01942 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HbaP01942 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HbaP01942 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HbaP01942 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HbaP01942 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HbaP01942 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HbaP01942 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms