Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01789 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01789 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01789 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01789 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01789 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01789 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01789 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01789 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01789 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01789 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01789 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01789 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01789 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01789 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01789 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01789 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01789 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01789 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01789 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01789 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01789 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01789 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01789 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01789 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01789 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01789 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01789 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01789 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01789 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01789 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01789 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01789 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01789 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01789 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01789 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01789 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01789 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01789 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01789 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01789 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01789 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01789 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01789 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01789 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01789 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01789 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01789 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01789 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01789 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01789 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01789 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01789 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01789 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01789 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01789 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01789 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01789 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01789 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01789 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01789 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01789 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01789 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01789 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01789 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01789 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01789 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01789 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01789 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01789 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01789 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01789 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01789 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01789 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01789 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01789 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01789 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01789 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01789 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01789 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01789 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01789 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01789 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01789 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01789 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01789 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01789 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01789 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01789 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01789 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01789 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01789 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01789 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01789 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01789 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01789 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01789 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01789 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01789 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01789 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms