Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna2P01573 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna2P01573 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna2P01573 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna2P01573 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna2P01573 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ifna2P01573 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna2P01573 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms