Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp8O89110 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp8O89110 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp8O89110 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp8O89110 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp8O89110 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp8O89110 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp8O89110 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp8O89110 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp8O89110 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp8O89110 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp8O89110 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp8O89110 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp8O89110 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp8O89110 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp8O89110 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casp8O89110 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp8O89110 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp8O89110 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms