Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema3fO88632 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sema3fO88632 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema3fO88632 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema3fO88632 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema3fO88632 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sema3fO88632 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sema3fO88632 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sema3fO88632 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sema3fO88632 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sema3fO88632 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema3fO88632 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema3fO88632 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sema3fO88632 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sema3fO88632 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sema3fO88632 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sema3fO88632 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Sema3fO88632 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sema3fO88632 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sema3fO88632 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema3fO88632 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema3fO88632 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sema3fO88632 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema3fO88632 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms