Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SfnO70456 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SfnO70456 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SfnO70456 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SfnO70456 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SfnO70456 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SfnO70456 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SfnO70456 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SfnO70456 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SfnO70456 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SfnO70456 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SfnO70456 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SfnO70456 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SfnO70456 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SfnO70456 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SfnO70456 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SfnO70456 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SfnO70456 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SfnO70456 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SfnO70456 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SfnO70456 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SfnO70456 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SfnO70456 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SfnO70456 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SfnO70456 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SfnO70456 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SfnO70456 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SfnO70456 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SfnO70456 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SfnO70456 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SfnO70456 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SfnO70456 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SfnO70456 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SfnO70456 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SfnO70456 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SfnO70456 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SfnO70456 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SfnO70456 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SfnO70456 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SfnO70456 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SfnO70456 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SfnO70456 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SfnO70456 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SfnO70456 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SfnO70456 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SfnO70456 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SfnO70456 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SfnO70456 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SfnO70456 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SfnO70456 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SfnO70456 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SfnO70456 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SfnO70456 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SfnO70456 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SfnO70456 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SfnO70456 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SfnO70456 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SfnO70456 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SfnO70456 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SfnO70456 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SfnO70456 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SfnO70456 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SfnO70456 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SfnO70456 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SfnO70456 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SfnO70456 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SfnO70456 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SfnO70456 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SfnO70456 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SfnO70456 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SfnO70456 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SfnO70456 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SfnO70456 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SfnO70456 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SfnO70456 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SfnO70456 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SfnO70456 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SfnO70456 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SfnO70456 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SfnO70456 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SfnO70456 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SfnO70456 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SfnO70456 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SfnO70456 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SfnO70456 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SfnO70456 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SfnO70456 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SfnO70456 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SfnO70456 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SfnO70456 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SfnO70456 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SfnO70456 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms