Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dnajb6O54946 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnajb6O54946 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnajb6O54946 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnajb6O54946 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnajb6O54946 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms