Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarce1O54941 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarce1O54941 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarce1O54941 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarce1O54941 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarce1O54941 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarce1O54941 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarce1O54941 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarce1O54941 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarce1O54941 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms