Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f6O54917 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f6O54917 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f6O54917 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f6O54917 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f6O54917 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f6O54917 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f6O54917 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f6O54917 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2f6O54917 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2f6O54917 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2f6O54917 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2f6O54917 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2f6O54917 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2f6O54917 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms