Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsg3O35902 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dsg3O35902 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dsg3O35902 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsg3O35902 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms