Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Socs1O35716 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Socs1O35716 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Socs1O35716 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Socs1O35716 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Socs1O35716 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Socs1O35716 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Socs1O35716 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Socs1O35716 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Socs1O35716 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Socs1O35716 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Socs1O35716 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Socs1O35716 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Socs1O35716 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Socs1O35716 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Socs1O35716 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Socs1O35716 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Socs1O35716 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms