Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn1O35350 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn1O35350 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn1O35350 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn1O35350 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn1O35350 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn1O35350 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn1O35350 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn1O35350 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn1O35350 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Capn1O35350 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn1O35350 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn1O35350 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn1O35350 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn1O35350 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn1O35350 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn1O35350 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn1O35350 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn1O35350 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms