Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd9O35177 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd9O35177 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nedd9O35177 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd9O35177 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nedd9O35177 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms