Protein–RNA interactions for Protein: O08747

Unc5c, Netrin receptor UNC5C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5cO08747 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Unc5cO08747 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Unc5cO08747 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Unc5cO08747 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Unc5cO08747 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Unc5cO08747 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Unc5cO08747 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Unc5cO08747 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Unc5cO08747 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms