Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp616J3QN14 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp616J3QN14 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp616J3QN14 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp616J3QN14 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp616J3QN14 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp616J3QN14 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp616J3QN14 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp616J3QN14 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp616J3QN14 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp616J3QN14 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp616J3QN14 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp616J3QN14 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms