Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp870J3QMA4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp870J3QMA4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp870J3QMA4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp870J3QMA4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zfp870J3QMA4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp870J3QMA4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp870J3QMA4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp870J3QMA4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp870J3QMA4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms