Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm21818J3KMS6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm21818J3KMS6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21818J3KMS6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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