Protein–RNA interactions for Protein: G3UY92

Vmn1r158, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r158G3UY92 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r158G3UY92 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r158G3UY92 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r158G3UY92 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r158G3UY92 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms