Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r167G3UW71 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r167G3UW71 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r167G3UW71 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r167G3UW71 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r167G3UW71 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r167G3UW71 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r167G3UW71 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r167G3UW71 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r167G3UW71 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms