Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rfx7F8VPJ6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rfx7F8VPJ6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rfx7F8VPJ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rfx7F8VPJ6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rfx7F8VPJ6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rfx7F8VPJ6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rfx7F8VPJ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rfx7F8VPJ6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rfx7F8VPJ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rfx7F8VPJ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rfx7F8VPJ6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Rfx7F8VPJ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rfx7F8VPJ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rfx7F8VPJ6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rfx7F8VPJ6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Rfx7F8VPJ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rfx7F8VPJ6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Rfx7F8VPJ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rfx7F8VPJ6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rfx7F8VPJ6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rfx7F8VPJ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Rfx7F8VPJ6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rfx7F8VPJ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rfx7F8VPJ6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rfx7F8VPJ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rfx7F8VPJ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Rfx7F8VPJ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms