Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm7535F7CXE4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm7535F7CXE4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm7535F7CXE4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm7535F7CXE4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm7535F7CXE4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms