Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Igkv1-99F6XWB2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igkv1-99F6XWB2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 951 ms