Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SmgcF6VRN1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SmgcF6VRN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SmgcF6VRN1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SmgcF6VRN1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmgcF6VRN1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms