Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4E9QAP7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4E9QAP7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4E9QAP7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4E9QAP7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms