Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc121E9Q6D3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc121E9Q6D3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc121E9Q6D3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc121E9Q6D3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc121E9Q6D3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc121E9Q6D3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc121E9Q6D3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc121E9Q6D3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc121E9Q6D3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc121E9Q6D3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc121E9Q6D3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms