Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aldh3b2E9Q3E1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aldh3b2E9Q3E1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aldh3b2E9Q3E1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh3b2E9Q3E1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms