Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gimd1E9PW74 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gimd1E9PW74 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gimd1E9PW74 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gimd1E9PW74 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gimd1E9PW74 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gimd1E9PW74 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gimd1E9PW74 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gimd1E9PW74 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gimd1E9PW74 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gimd1E9PW74 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gimd1E9PW74 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gimd1E9PW74 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gimd1E9PW74 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gimd1E9PW74 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms