Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3002E9PW72 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3002E9PW72 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3002E9PW72 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3002E9PW72 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3002E9PW72 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3002E9PW72 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3002E9PW72 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3002E9PW72 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3002E9PW72 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3002E9PW72 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3002E9PW72 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms