Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700006A11RikB9EHI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700006A11RikB9EHI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700006A11RikB9EHI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700006A11RikB9EHI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700006A11RikB9EHI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700006A11RikB9EHI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700006A11RikB9EHI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms