Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cpb1B2RS76 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpb1B2RS76 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpb1B2RS76 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cpb1B2RS76 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpb1B2RS76 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpb1B2RS76 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cpb1B2RS76 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cpb1B2RS76 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpb1B2RS76 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpb1B2RS76 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpb1B2RS76 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpb1B2RS76 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpb1B2RS76 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpb1B2RS76 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cpb1B2RS76 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms