Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pm20d2A3KG59 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pm20d2A3KG59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pm20d2A3KG59 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pm20d2A3KG59 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms