Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syndig1A2ANU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1A2ANU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syndig1A2ANU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syndig1A2ANU3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syndig1A2ANU3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms