Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdccag3A2AIW0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdccag3A2AIW0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdccag3A2AIW0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdccag3A2AIW0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sdccag3A2AIW0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms