Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbf1A2A870 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbf1A2A870 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbf1A2A870 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbf1A2A870 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms