Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdr2lA2A6T1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdr2lA2A6T1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdr2lA2A6T1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdr2lA2A6T1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdr2lA2A6T1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdr2lA2A6T1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdr2lA2A6T1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdr2lA2A6T1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdr2lA2A6T1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms