Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28171A0A087WQ19 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Gm28171A0A087WQ19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28171A0A087WQ19 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gm28171A0A087WQ19 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gm28171A0A087WQ19 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gm28171A0A087WQ19 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28171A0A087WQ19 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Gm28171A0A087WQ19 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28171A0A087WQ19 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm28171A0A087WQ19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms