Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edf1Q9JMG1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms