Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms