Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM11

Tgm6, Transglutaminase 6, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm6Q8BM11 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tgm6Q8BM11 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tgm6Q8BM11 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tgm6Q8BM11 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tgm6Q8BM11 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm6Q8BM11 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm6Q8BM11 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms