Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4b4J3QNS5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mfsd4b4J3QNS5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 346.5 ms