Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad1Q9D5T0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad1Q9D5T0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms